研究者首次發(fā)現(xiàn)孕婦染色體外環(huán)狀DNA

    人血漿中細(xì)胞游離的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人們廣泛研究的領(lǐng)域。在懷孕期間，觀(guān)察到胎兒血漿DNA（主要是胎盤(pán)來(lái)源）是線(xiàn)性DNA片段，比母體來(lái)源（主要是造血來(lái)源）DNA短。有研究報(bào)道了人和鼠血漿中存在染色體外環(huán)狀DNA（eccDNA）。但是，尚無(wú)有關(guān)孕婦血漿中eccDNA的公開(kāi)數(shù)據(jù)。

    2020年1月3日，香港大學(xué)盧煜明團(tuán)隊(duì)在PNAS 在線(xiàn)發(fā)表題為“Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasma”的研究論文，該研究通過(guò)限制性酶或Tn5轉(zhuǎn)座酶處理后的測(cè)序，在孕婦血漿中首次鑒定了eccDNA分子。這些eccDNA分子顯示出雙峰大小分布，峰值分布在?202和?338 bp，在兩個(gè)峰的整個(gè)大小范圍內(nèi)觀(guān)察到明顯的10 bp周期性，表明它們的核小體起源。此外，胎兒來(lái)源的eccDNA比產(chǎn)婦的eccDNA短。eccDNA分子總體種群的基因組注釋顯示，這些分子優(yōu)先從5‘非翻譯區(qū)（5’-UTR）、外顯子區(qū)和CpG島區(qū)生成。eccDNA的連接位點(diǎn)兩側(cè)的兩組三核苷酸重復(fù)基序支持eccDNA產(chǎn)生的多種可能模型。

    這項(xiàng)工作強(qiáng)調(diào)了血漿DNA的拓?fù)浞治?，這是循環(huán)核酸研究和應(yīng)用的新興方向。