細胞轉(zhuǎn)錄組的時空調(diào)節(jié)對細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的正常表達及細胞功能至關(guān)重要。然而，由于現(xiàn)有轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法不能同時獲得時間和空間數(shù)據(jù)。美國麻省理工學(xué)院研究團隊開發(fā)了時空轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)，并應(yīng)用于探究RNA的生成、轉(zhuǎn)運和降解速率，在亞細胞水平揭示RNA的動力學(xué)圖譜。該研究成果于近日發(fā)表在《Nature Methods》上，題為：Spatiotemporally resolved transcriptomics reveals the subcellular RNA kinetic landscape。
研究人員利用修飾堿基5-乙炔尿苷建立了一種具有單細胞分辨率且能跨時間和空間獲得RNA概況的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)（TEMPOmap）。利用該技術(shù)，研究人員在亞細胞水平構(gòu)建了多種人類細胞RNA從轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)運到降解的動力學(xué)圖譜。對單個細胞的RNA動力學(xué)參數(shù)進行聚類分析，他們提出了“動力學(xué)基因簇”。這些基因簇有不同的時間表達特征和亞細胞分布，在功能上也相互獨立，表明不同功能RNA在細胞周期內(nèi)被動態(tài)調(diào)控。
綜上，研究人員建立的時空轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)可為精準研究RNA時空調(diào)控和發(fā)現(xiàn)新的基因表達調(diào)控機制提供工具。
注：此研究成果摘自《Nature Methods》期刊原文章，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場，僅供參考。
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